Skip to main content

Table 1 Informativeness (I_n) and allele frequency differences (δ) between seven continental regions for SNPs on the 41-AIM panel

From: Inference of human continental origin and admixture proportions using a highly discriminative ancestry informative 41-SNP panel

Continental regions: 1 = Africa, 2 = the Americas, 3 = Central/South Asia, 4 = East Asia, 5 = Europe, 6 = the Middle East, 7 = Oceania

SNP

I_n

1-2

1-3

1-4

1-5

1-6

1-7

2-3

2-4

2-5

2-6

2-7

3-4

3-5

3-6

3-7

4-5

4-6

4-7

5-6

5-7

6-7

rs1834640

0.406

0.367

0.838

0.090

0.945

0.918

0.004

0.471

0.277

0.578

0.551

0.371

0.749

0.107

0.080

0.842

0.855

0.828

0.093

0.027

0.949

0.921

rs9809818*

0.364

0.811

0.355

0.822

0. 057

0.079

0.972

0.455

0.012

0.754

0.731

0.162

0.467

0.299

0.276

0.617

0.765

0.743

0.150

0.023

0.916

0.893

rs310644

0.352

0.909

0.741

0.925

0.899

0.812

0.063

0.168

0.016

0.010

0.097

0.846

0.184

0.158

0.071

0.678

0.026

0.114

0.862

0.087

0.836

0.749

rs1834619*

0.334

0.953

0.280

0.723

0.073

0.028

0.714

0.673

0.230

0.880

0.926

0.239

0.443

0.207

0.252

0.434

0.650

0.695

0.008

0.045

0.642

0.687

rs1572018*

0.320

0.930

0.718

0.340

0.877

0.724

0.036

0.212

0.590

0.053

0.206

0.894

0.378

0.159

0.006

0.682

0.537

0.384

0.304

0.153

0.841

0.688

rs7226659*

0.318

0.415

0.055

0.575

0.002

0.019

0.950

0.360

0.160

0.417

0.396

0.535

0.520

0.057

0.036

0.894

0.577

0.556

0.375

0.021

0.952

0.931

rs260714*

0.302

0.064

0.589

0.107

0.705

0.601

0.164

0.653

0.043

0.769

0.665

0.099

0.696

0. 116

0.012

0.752

0.812

0.708

0.056

0.104

0.868

0.764

rs4918664

0.287

0.855

0.285

0.869

0.147

0.038

0.174

0.569

0.014

0.708

0.816

0.681

0.583

0.138

0.247

0.111

0.722

0.830

0.695

0.109

0.027

0.136

rs4471745

0.284

0.097

0.003

0.023

0.050

0.104

0.869

0.094

0.120

0.048

0.006

0.967

0.025

0.047

0.101

0.872

0.072

0.126

0.847

0.054

0.919

0.973

rs11725412

0.272

0.704

0.047

0.432

0.186

0.243

0.421

0.751

0.272

0.890

0.947

0.284

0.479

0.138

0.196

0.468

0.617

0.675

0.011

0.058

0.606

0.664

rs3098610

0.271

0.761

0.328

0.849

0.265

0.399

0.980

0.433

0.088

0.496

0.362

0.219

0.521

0.063

0.071

0.652

0.584

0.450

0.131

0.134

0.715

0.581

rs4664511

0.268

0.568

0.143

0.502

0.043

0.090

0.833

0.424

0.066

0.611

0.658

0.266

0.358

0.187

0.233

0.690

0.545

0.591

0.332

0.047

0.877

0.923

rs10079352

0.267

0.975

.0540

0.957

0.459

0.312

0.419

0.434

0.017

0.516

0.662

0.556

0.417

0.082

0.228

0.121

0.499

0.645

0.539

0.146

0.040

0.107

rs2166624

0.262

0.977

0.323

0.430

0.383

0.224

0.000

0.654

0.546

0.594

0.753

0.977

0.108

0.060

0.099

0.323

0.047

0.206

0.430

0.159

0.383

0.224

rs12498138

0.247

0.906

0.070

0.090

0.060

0.040

0.089

0.836

0.817

0.846

0.866

0.817

0.020

0.010

0.030

0.019

0.029

0.050

0.000

0.020

0.029

0.049

rs7251928

0.245

0.966

0.778

0.942

0.741

0.662

0.787

0.188

0.024

0.225

0.304

0.179

0.164

0.037

0.116

0.009

0.201

0.280

0.155

0.079

0.046

0.125

rs6990312

0.244

0.457

0.516

0.787

0.621

0.505

0.166

0.060

0.330

0.164

0.048

0.623

0.271

0.104

0.012

0.683

0.166

0.282

0.953

0.116

0.787

0.671

rs3823159

0.242

0.477

0.859

0.745

0.904

0.815

0.371

0.382

0.268

0.427

0.338

0.106

0.114

0.044

0.045

0.488

0.158

0.070

0.374

0.089

0.533

0.444

rs2024566

0.236

0.903

0.257

0.012

0.218

0.239

0.056

0.647

0.891

0.685

0.664

0.959

0.245

0.039

0.017

0.312

0.206

0.228

0.067

0.022

0.273

0.295

rs7722456

0.235

0.362

0.268

0.351

0.175

0.178

0.569

0.094

0.011

0.187

0.184

0.931

0.084

0.093

0.089

0.836

0.176

0.173

0.920

0.003

0.744

0.747

rs9880567

0.232

0.567

0.326

0.441

0.307

0.353

0.402

0.241

0.126

0.260

0.214

0.969

0.115

0.019

0.027

0.728

0.134

0.088

0.843

0.046

0.709

0.755

rs842639

0.231

0.706

0.340

0.603

0.014

0.062

0.674

0.366

0.103

0.692

0.768

0.032

0.263

0.326

0.402

0.334

0.589

0.665

0.071

0.076

0.660

0.735

rs10497191

0.230

0.883

0.858

0.893

0.822

0.768

0.889

0.024

0.010

0.061

0.115

0.007

0.035

0.037

0.091

0.031

0.072

0.126

0.004

0.054

0.068

0.122

rs734241

0.227

0.899

0.211

0.311

0.003

0.035

0.464

0.688

0.589

0.896

0.864

0.435

0.100

0.208

0.176

0.253

0.308

0.276

0.153

0.032

0.461

0.429

rs735480*

0.224

0.459

0.755

0.597

0.895

0.815

0.205

0.296

0.138

0.436

0.356

0.255

0.158

0.140

0.060

0.551

0.298

0.218

0.393

0.080

0.691

0.611

rs2593595

0.218

0.615

0.688

0.805

0.753

0.683

0.990

0.073

0.189

0.138

0.068

0.375

0.117

0.065

0.004

0.303

0.052

0.121

0.186

0.069

0.237

0.307

rs2717329

0.213

0.762

0.603

0.710

0.759

0.520

0.980

0.159

0.052

0.003

0.241

0.219

0.107

0.156

0.083

0.378

0.049

0.189

0.271

0.239

0.222

0.460

rs10961366*

0.213

0.019

0.254

0.023

0.254

0.278

0.623

0.235

0.042

0.235

0.259

0.642

0.277

0.000

0.024

0.876

0.277

0.301

0.600

0.024

0.877

0.900

rs1557553

0.207

0.887

0.080

0.273

0.085

0.045

0.195

0.806

0.614

0.802

0.842

0.692

0.193

0.004

0.036

0.114

0.188

0.228

0.078

0.040

0.110

0.150

rs4741658*

0.202

0.742

0.458

0.774

0.225

0.117

0.630

0.285

0.032

0.518

0.626

0.113

0.317

0.233

0.341

0.172

0.549

0.658

0.144

0.108

0.405

0.513

rs2196051

0.202

0.012

0.228

0.002

0.645

0.493

0.020

0.216

0.014

0.633

0.481

0.031

0.230

0.417

0.265

0.248

0.647

0.495

0.018

0.152

0.665

0.512

rs6737672

0.199

0.977

0.585

0.620

0.516

0.561

0.321

0.392

0.357

0.461

0.415

0.655

0.035

0.069

0.024

0.264

0.104

0.059

0.299

0.046

0.194

0.240

rs10877030

0.185

0.472

0.082

0.231

0.197

0.318

0.460

0.390

0.241

0.669

0.790

0.012

0.149

0.279

0.400

0.378

0.428

0.549

0.229

0.122

0.657

0.779

rs7837234

0.162

0.113

0.003

0.271

0.039

0.044

0.619

0.110

0.158

0.152

0.069

0.732

0.268

0.042

0.041

0.622

0.310

0.227

0.890

0.083

0.580

0.663

rs4907251

0.157

0.843

0.550

0.528

0.205

0.242

0.475

0.292

0.315

0.638

0.600

0.367

0.023

0.346

0.308

0.075

0.323

0.286

0.052

0.038

0.271

0.233

rs1863086

0.149

0.658

0.133

0.214

0.255

0.116

0.310

0.525

0.872

0.403

0.542

0.348

0.347

0.122

0.017

0.177

0.469

0.330

0.524

0.139

0.055

0.194

rs310362*

0.147

0.763

0.476

0.533

0.627

0.279

0.751

0.287

0.229

0.136

0.484

0.011

0.058

0.151

0.197

0.276

0.094

0.255

0.218

0.349

0.124

0.473

rs4705360

0.139

0.701

0.300

0.397

0.047

0.011

0.419

0.401

0.304

0.654

0.712

0.282

0.097

0.253

0.312

0.119

0.350

0.409

0.021

0.058

0.372

0.430

rs4833103

0.110

0.016

0.038

0.009

0.449

0.104

0.000

0.022

0.007

0.434

0.089

0.016

0.029

0.412

0.067

0.038

0.441

0.096

0.009

0.345

0.449

0.104

rs359955*

0.090

0.455

0.533

0.613

0.639

0.298

0.410

0.078

0.158

0.183

0.157

0.046

0.080

0.106

0.235

0.124

0.026

0.315

0.204

0.341

0.229

0.111

rs12878166

0.078

0.137

0.220

0.413

0.098

0.259

0.038

0.356

0.549

0.039

0.396

0.174

0.193

0.317

0.039

0.182

0.510

0.154

0.375

0.356

0.135

0.221

  1. *Not on the 31-AIM panel.